La bandera de la Institución está formada por un rectángulo según diseño: Una franja de color azul cielo en la parte superior, una franja más delgada de color amarillo claro en el centro y una franja color blanco de igual dimensión que la azul, en la parte inferior. En el centro el escudo de la Institución.
El COLOR AZUL CLARO simboliza la devoción Mariana, el amor, la honestidad, la amistad y la armonía, entre todos los miembros que conforman la comunidad educativa Laurista.
La FRANJA AMARILLA simboliza la luz que ilumina el camino de formación, que la Institución Educativa Madre Laura quiere infundir en los educandos, haciendo de ellos hombres y mujeres éticos, críticos, pensantes e investigativos, democráticos, fraternos, responsables, honorables, amantes de la naturaleza y sobre todo cristianos de compromiso capaces de vivir en comunidad, de ser solidarios, abiertos al diálogo, al perdón, gestores de desarrollo y agentes de cambio social.
El estudiante de la Institución Educativa Madre Laura, recibe la luz de la sabiduría, la proyecta y la hace praxis en todo su entorno social.
El COLOR BLANCO simboliza la defensa de la vida y la paz, la convivencia pacífica, la pureza, sinceridad y la sencillez que debe caracterizar al estudiante de la institución